Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PUM3Q15397 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms