Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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NFIXQ14938 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NFIXQ14938 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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