Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RFTN1Q14699 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RFTN1Q14699 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms