Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGB1Q14028 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms