Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBA3CQ13748 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TUBA3CQ13748 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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