Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms