Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PEX6Q13608 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PEX6Q13608 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PEX6Q13608 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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