Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA5AQ13591 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA5AQ13591 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms