Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCIRG1Q13488 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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