Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IKZF1Q13422 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
IKZF1Q13422 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms