Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SCGB2A2Q13296 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms