Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLAMF1Q13291 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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