Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRIN2AQ12879 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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