Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms