Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RBBP4Q09028 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms