Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CD300CQ08708 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms