Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LOXL1Q08397 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms