Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms