Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms