Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms