Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUCB1Q02818 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms