Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCNT1Q02742 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCNT1Q02742 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms