Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLTCQ00610 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms