Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDC42EP1Q00587 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms