Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CDK5Q00535 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDK5Q00535 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDK5Q00535 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CDK5Q00535 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms