Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GEMP55040 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GEMP55040 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GEMP55040 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms