Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDE6CP51160 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms