Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CRIP1P50238 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms