Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTSOP43234 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTSOP43234 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms