Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER3P43115 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms