Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBX2P40425 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PBX2P40425 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBX2P40425 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PBX2P40425 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PBX2P40425 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms