Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms