Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB3P28472 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms