Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLD1P28340 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms