Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2AP24928 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2AP24928 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms