Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD247P20963 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD247P20963 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD247P20963 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms