Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms