Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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