Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD8P13378 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms