Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms