Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN1P12814 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms