Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL6A2P12110 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms