Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MTHFD1P11586 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms