Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI3P10071 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI3P10071 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI3P10071 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms