Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEFLP07196 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFLP07196 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFLP07196 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEFLP07196 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFLP07196 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFLP07196 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEFLP07196 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms