Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFIP05156 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFIP05156 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFIP05156 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms