Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFP01375 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFP01375 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFP01375 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms