Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTCP00480 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTCP00480 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTCP00480 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms