Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL18O94889 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms