Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms